Може да се возиш и с метрото. От летището Т2 вземаш линия номер 8 до спирка "Nuevos Ministerios" (около 20 минути) и там се прекачваш на линия 1, която пътува до гарата. Билета за метрото е 2,50 Е. Има едно прекачване, но пак е удобно.
Според мен най-удобно е да вземеш експресния автобус, на летището мисля че се вземаше от терминал 4, 2 и 1. Той спира първо на спирки O'Donell и Cibeles, и след това на Atocha, билета е 5 евро и се купува от шофьора. През деня се движи на 20 мин. и до гарата се пътува 40, но си зависи и от трафика. Автобуса има нощна линия, еднопосочен билет за нея е около 10 евро, но се движи само до спирка Cibeles и от там трябва да се прехвърлиш на градски нощен автобус.
Друг удобен вариант и по-евтин е да вземеш градски влак (cercanias) С1 от летището (Т4) към спирка Рrincipe Рio, влакът минава и през Atocha. Билета е 2,50 евро. Пътува се около 45 мин.